127例古基因组揭示青藏高原“幽灵祖先”与南亚语系族群遗传起源｜封面科考队

封面新闻记者(xīnwénjìzhě) 谭羽清 青藏高原人群的遗传起源一直是学界关注(guānzhù)的热点，其中“幽灵祖先”的存在长期以来缺乏直接来源(láiyuán)的代表性(dàibiǎoxìng)人群。此外，南亚语系族群的起源和扩散模式也一直存在争议。最新研究为这两个问题提供(tígōng)了突破性答案。 北京时间5月30日，国际学术期刊《科学（ Science）》 发表了一项(yīxiàng)作为(zuòwéi)亮点文章推荐的(de)研究。该研究由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所（以下简称“古脊椎所”）付巧妹研究团队和云南省文物考古(kǎogǔ)研究所，联合四川大学、兰州大学、西北大学等(děng)机构历经9年共同完成。在研究中，科学家团队成功捕获和测序了来自17个(gè)遗址的127例距今7,100年以来的云南古代人类基因组。 本研究不仅填补了东亚和东南亚史前人群(rénqún)遗传数据的关键空白，更是首次从遗传学角度精准识别了青藏高原(qīngzànggāoyuán)的“幽灵祖先”之一，同时揭示了南亚语系人群的遗传起源，并深入探讨了云南作为(zuòwéi)多元人群交流(jiāoliú)枢纽的关键作用。 7,100年前遗址个体解码青藏高原“幽灵(yōulíng)祖先”之谜 青藏高原(qīngzànggāoyuán)人群的遗传结构一直(yìzhí)存在未解(wèijiě)之谜。根据本团队此前发表的研究成果，自距今5,100年前至今，青藏高原人群的遗传成分约80%源自9500年-4000年前的中国(zhōngguó)北方人群，但剩余的20%来源不明，被学界称为“幽灵祖先”。这一成分的来源一直未能(wèinéng)确定，备受国际关注。 本研究的重要突破在于发现了一名距今7,100年的云南兴义遗址个体“Xingyi_EN”，其基因组中携带了一种此前未被(bèi)识别的、深度分化的亚洲遗传成分。研究团队将其命名为“亚洲基部兴义祖先(zǔxiān)”。进一步分析发现，这一遗传成分不仅在古代青藏高原(qīngzànggāoyuán)(qīngzànggāoyuán)人群中有贡献，也在现代藏族基因组中保留，证明“Xingyi_EN”为代表的古老人群正是此前学界推测(tuīcè)但未能精准(jīngzhǔn)定位的青藏高原“幽灵祖先”之一(zhīyī)。 这一(zhèyī)重大发现填补了关于青藏高原早期人群起源的空白，基本厘清(líqīng)了青藏高原人群的遗传起源问题，拨散了“幽灵祖先(zǔxiān)”的疑云。研究表明，这一“幽灵祖先”至少在(zài)距今40,000年前(niánqián)就已从其(qí)他亚洲人群分化，并在云南地区(dìqū)长期存续，直到至少7,100年前仍(réng)有人群携带(xiédài)这一成分。另外值得注意的是，比其早的距今11,000年前的广西隆林个体也含有兴义祖先成分，是兴义祖先成分和古南方成分的混合，但该成分在广西8,000-6000人群急剧下降，且在历史时期人群中已消失，而在青藏高原人群中得以(déyǐ)保留，成为其遗传结构的重要组成部分。这一发现不仅为高原人群的来源研究提供了关键线索，也为东亚人群的迁徙和演化过程提供了新的证据。 基因组数据研究揭示南亚语系族群的(de)遗传起源 南亚(nányà)语系族群，如佤族、布朗族，以及越南、柬埔寨、老挝等地的部分民族主要分布于印度东北部(dōngběibù)、中国南部和东南亚，其起源及扩散模式长期存在争议，尚不清楚他们的起源地、扩散时间、扩散路径等问题。目前主流假设主要基于语言学推测(tuīcè)，提出了不同的起源地，包括印度东北部、云南三江地区(dìqū)、长江中游(zhōngyóu)地区和湄公河流域，缺乏直接(zhíjiē)的遗传学证据。 本研究首次通过基因组数据发现，云南中部距今5,500至1,400年的(de)人群，携带一种迄今未被识别(shíbié)的独特东亚祖源，不同于东亚古北方(běifāng)或古南方人群。研究团队将其命名为(wèi)“云南中部祖先人群”，并发现这一祖源与当今南亚语系人群密切相关，表明云南可能是南亚语系族群的早期核心(héxīn)区域之一。 科研团队结合(jiéhé)考古学、语言学和遗传学证据，研究(yánjiū)推测(tuīcè)南亚语系(yǔxì)族群可能沿红河流域向东南亚扩张。云南中部祖先人群的(de)遗传成分不仅出现在古代东南亚人群中，还在广西部分历史时期人群中有所体现，很有可能南亚语系人群从云南中部地区沿中国红河流域向东南亚扩张的迁徙模式，而非之前认为印度(yìndù)或者东南亚起源。这一(zhèyī)发现刷新了南亚语系起源的相关假设，提出云南中部的重要性，并促使学界重新审视南亚语系人群的形成与传播模式。 云南(yúnnán)：史前人类多元交流的遗传枢纽 研究还揭示，早在(zài)青铜时代，云南已成为不同(bùtóng)族群交流与融合的中心，并展现出高度复杂的人群结构： 云南西部(xībù)人群以东亚北方祖源为主，与(yǔ)黄河流域农业人群存在遗传联系。相关古代个体分别来自磨盘山遗址、白羊村遗址、高寨遗址、堆子遗址、红(hóng)土坡遗址、大墩子遗址、江西坟遗址、江边(jiāngbiān)遗址、腊甸遗址、吉岔遗址。 云南中部(zhōngbù)以云南中部祖先人群为主，成为南亚语系族群的重要基因来源。遗址(yízhǐ)包括：兴义遗址、古城村遗址、海宝山遗址、金砂(jīnshā)山遗址、金莲山遗址、学山遗址。 云南(yúnnán)东部人群兼具东亚南方和云南中部祖先成分的(de)混合特征，主要来自距今3444-3180年的大阴洞遗址。 此外，兴义遗址的(de)研究揭示了人群生业模式的演变。结合同位素研究，该(gāi)研究发现兴义人群在距今4900年前开始从狩猎(shòuliè)采集(cǎijí)向农业过渡，经历(jīnglì)了狩猎采集（7000-5300年前）—采集与农业混合（4900-4300年前）—更集约化的农业（3800-3300年前）的过程。从7100-5500年前观察到的遗传(yíchuán)变化，是狩猎采集者内部的转变。然而，尽管(jǐnguǎn)食物结构发生了变化，兴义人群在5500-3300年前的遗传结构保持稳定，说明生计模式的变迁并未伴随(bànsuí)外来人群的大规模迁徙，向农业实践(shíjiàn)的转变并未伴随着祖源成分的变化。 同时，研究团队通过对云南金莲山遗址（2000-1400年前(niánqián)）和高寨遗址（2500-2100年前）的分析，发现墓葬中的个体可能跨越三到十代以上的家族谱系。这一发现表明，史前云南人群高度重视(gāodùzhòngshì)家族血缘关系，并(bìng)可能遵循稳定的宗族葬俗。这为古代云南社会组织、家庭(jiātíng)结构(jiégòu)和文化传统提供了重要的遗传学证据，也有助于探讨(tàntǎo)东亚地区早期社会形态的演变。 本研究的发现对理解青藏高原人群(rénqún)来源、南亚语系族群的起源以及云南作为人群交流枢纽的作用(zuòyòng)具有里程碑式意义。 本文章的通讯作者(zuòzhě)(zuòzhě)和共同第一作者为中国科学院(zhōngguókēxuéyuàn)古脊椎动物与古人类(gǔrénlèi)研究所付巧妹研究员。共同第一作者为原中国科学院古脊椎所博士研究生王恬怡、原中国科学院古脊椎所博士后现为美国里士满大学助理教授Melinda A.Yang、云南省文物考古研究所朱忠华(zhūzhōnghuá)、兰州大学马敏敏。